feat: 实现插件系统并修复文档配置格式

- 实现基于环境变量的插件系统，支持按需启用/禁用工具
- 添加默认插件配置，开箱即用
- 更新所有 MCP 配置示例，使用 mcp.json env 部分而非 export 命令
- 符合 MCP 惯例，解决工具数量限制问题

Co-authored-by: Booker Zhao <binggg@users.noreply.github.com>

Author: claude[bot]